Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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