Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.1 ms