Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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UBXN4Q92575 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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UBXN4Q92575 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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UBXN4Q92575 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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UBXN4Q92575 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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UBXN4Q92575 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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