Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCBE1Q6UXH8 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.4 ms