Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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CCDC142Q17RM4 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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CCDC142Q17RM4 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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CCDC142Q17RM4 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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