Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms