Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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