Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNCBQ16143 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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