Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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VPS72Q15906 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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VPS72Q15906 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
VPS72Q15906 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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VPS72Q15906 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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VPS72Q15906 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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VPS72Q15906 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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