Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNHIT3Q15649 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms