Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TAF1AQ15573 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TAF1AQ15573 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms