Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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PTPRKQ15262 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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PTPRKQ15262 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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PTPRKQ15262 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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PTPRKQ15262 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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PTPRKQ15262 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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PTPRKQ15262 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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PTPRKQ15262 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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PTPRKQ15262 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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PTPRKQ15262 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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PTPRKQ15262 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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