Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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BRD3Q15059 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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BRD3Q15059 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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BRD3Q15059 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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BRD3Q15059 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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BRD3Q15059 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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BRD3Q15059 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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BRD3Q15059 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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BRD3Q15059 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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BRD3Q15059 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
BRD3Q15059 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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