Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAM2Q15035 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms