Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
R3HDM1Q15032 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms