Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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GPNMBQ14956 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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GPNMBQ14956 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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GPNMBQ14956 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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GPNMBQ14956 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
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GPNMBQ14956 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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GPNMBQ14956 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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GPNMBQ14956 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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