Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIXQ14938 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms