Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms