Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CNGB1Q14028 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms