Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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