Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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