Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms