Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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