Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEMA3BQ13214 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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