Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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TRAF1Q13077 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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TRAF1Q13077 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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TRAF1Q13077 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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TRAF1Q13077 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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TRAF1Q13077 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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TRAF1Q13077 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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TRAF1Q13077 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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