Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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GRIK3Q13003 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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GRIK3Q13003 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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GRIK3Q13003 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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GRIK3Q13003 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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