Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms