Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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PTPRMP28827 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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PTPRMP28827 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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PTPRMP28827 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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PTPRMP28827 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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PTPRMP28827 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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PTPRMP28827 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRMP28827 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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