Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRGP23470 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRGP23470 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms