Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRDP23468 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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