Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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PTPRBP23467 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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PTPRBP23467 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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PTPRBP23467 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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PTPRBP23467 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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PTPRBP23467 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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