Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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TRIM35Q9UPQ4 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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TRIM35Q9UPQ4 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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TRIM35Q9UPQ4 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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TRIM35Q9UPQ4 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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TRIM35Q9UPQ4 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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TRIM35Q9UPQ4 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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