Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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