Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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CHCHD4Q8N4Q1 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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CHCHD4Q8N4Q1 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
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CHCHD4Q8N4Q1 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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CHCHD4Q8N4Q1 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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CHCHD4Q8N4Q1 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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CHCHD4Q8N4Q1 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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CHCHD4Q8N4Q1 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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CHCHD4Q8N4Q1 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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