Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms