Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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