Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms