Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TNXAQ16473 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms