Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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