Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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GRIK4Q16099 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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GRIK4Q16099 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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GRIK4Q16099 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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GRIK4Q16099 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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GRIK4Q16099 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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GRIK4Q16099 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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GRIK4Q16099 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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