Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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NEDD8Q15843 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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NEDD8Q15843 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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NEDD8Q15843 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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