Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNA6Q15825 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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