Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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NCOA1Q15788 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NCOA1Q15788 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NCOA1Q15788 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NCOA1Q15788 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NCOA1Q15788 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NCOA1Q15788 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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