Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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SHHQ15465 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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SHHQ15465 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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