Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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