Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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