Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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