Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHPRHQ149N8 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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