Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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COL9A3Q14050 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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