Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
APOFQ13790 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
APOFQ13790 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
APOFQ13790 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
APOFQ13790 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
APOFQ13790 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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APOFQ13790 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
APOFQ13790 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
APOFQ13790 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
APOFQ13790 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
APOFQ13790 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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APOFQ13790 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
APOFQ13790 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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APOFQ13790 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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APOFQ13790 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
APOFQ13790 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
APOFQ13790 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
APOFQ13790 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
APOFQ13790 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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